La Universidad de Aalborg se abrió en 1974, convirtiéndose en la quinta universidad en Dinamarca. Desde su apertura, diferentes instituciones y escuelas se han unido a ella. En 1995 el Colegio de la ingeniería de Eesberg fue integrado en la universidad. Después, se creó la Escuela de Arquitectura y Diseño en 1996. El campus de la Universidad de Aalborg en Copenhague se instaló en el año 2003 (el Instituto de Copenhague de Tecnología), mientras que la Escuela de Medicina  y la integración del Instituto de investigación de Edificio Nacional, dos de los principales valuartes de la Universidad, se añadieron en los años 2006 y 2007 respectivamente.

La Universidad de Aalbrog se diferencia de las universidades más viejas y más tradicionales danesas con un plan de estudios experimental basado en un curso interdisciplinario básico con especialización subsecuente; una estructura pedagógica basada en el problema, proyectos educativos y la importancia de investigación – que internacionalmente se conoce como el Experimento de Aalborg o el Modelo de Aalborg.

Este modelo se basa en la organización de un proyecto en el que el trabajo de estudiante gira alrededor de los problemas cotidianos y complejos sobre los cuales los estudiantes se preguntan y tratan de encontrar respuestas mediante procedimientos científicos. Estos trabajos característicos de la Universidad de Aalborg se realizan en grupos.

Actualmente, la Universidad de Aalbrog tiene las siguientes facultades: Humanidades, Ciencias Sociales, Ingeniería, Ciencia y Medicina.